TweakUI
Итак, допустим, что вы запускаете пакетный файл start.cmd из [GuiRunOnce]. Тогда в этот файл надо включить следующие строки
ECHO Installing TweakUI 2.10 Powertoy
ECHO Please wait...
start /wait %systemdrive%\Install\TweakUI.msi /qn
ECHO.
Если же вы используете RunOnceEx, то тогда в этом файле должны быть следующие параметры
REG ADD %KEY%\020 /VE /D "TweakUI" /f
REG ADD %KEY%\020 /V 1 /D "%systemdrive%\Install\TweakUI.msi /qn" /f
Думаю, что понятно, что приложение TweakUI.msi запускается с ключом /qn. Обратите внимание, что во втором методе используются кавычки, впрочем это относится к синтаксису файла RunOnceEx.cmd, а не к ключам приложения.
Теперь посмотрим какие ключи используются для других приложений.